本總隊前身為台灣省保安警察第一總隊第二大隊

於民國七十八年因應治安任務需要

奉核定將原來台灣省保安警察第一總隊第二大隊

擴編為保安警察第五總隊

於民國七十九年元月一日在岡山營區成立

直屬於內政部警政署